A gélelektroforézist vízszintes vagy függőleges helyzetben is lehet végezni. A vízszintes gélek jellemzően agaróz mátrixból állnak. Ezeknek a géleknek a pórusmérete a kémiai komponensek koncentrációjától függ: az agarózgél pórusai (100-500 nm átmérőjű) nagyobbak és kevésbé egyenletesek, mint az akrilamid gélpórusoké (10-200 nm átmérőjű). Összehasonlításképpen a DNS- és RNS-molekulák nagyobbak, mint egy lineáris fehérjeszál, amelyek gyakran denaturálódnak a folyamat előtt vagy közben, így könnyebben elemezhetők. Így a DNS és RNS molekulák gyakrabban futnak agaróz gélen (vízszintesen).DYCP-31DN rendszerünk egy horizontális elektroforézis rendszer. Ez a fröccsöntött gélöntő eszköz 4 különböző méretű gélt készíthet különböző géltálcákon.
